Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms