Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN4Q8IWV2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN4Q8IWV2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms