Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9A9Q8IVB4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC9A9Q8IVB4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms