Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VSIG1Q86XK7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms