Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFR1Q86XK3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFR1Q86XK3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms