Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms