Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX20Q7Z614 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms