Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RD3Q7Z3Z2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms