Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT25Q7Z3Z0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT25Q7Z3Z0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT25Q7Z3Z0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT25Q7Z3Z0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT25Q7Z3Z0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT25Q7Z3Z0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT25Q7Z3Z0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT25Q7Z3Z0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT25Q7Z3Z0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms