Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A5Q71RS6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A5Q71RS6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A5Q71RS6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A5Q71RS6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A5Q71RS6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A5Q71RS6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A5Q71RS6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A5Q71RS6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A5Q71RS6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A5Q71RS6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A5Q71RS6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A5Q71RS6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A5Q71RS6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A5Q71RS6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC24A5Q71RS6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC24A5Q71RS6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC24A5Q71RS6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC24A5Q71RS6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A5Q71RS6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A5Q71RS6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A5Q71RS6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A5Q71RS6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A5Q71RS6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A5Q71RS6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A5Q71RS6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A5Q71RS6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms