Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYDE1Q6ZW31 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms