Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU65

UBN2, Ubinuclein-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN2Q6ZU65 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBN2Q6ZU65 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBN2Q6ZU65 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBN2Q6ZU65 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms