Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP1Q6WKZ4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP1Q6WKZ4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms