Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms