Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms