Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX73

C16orf89, UPF0764 protein C16orf89, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf89Q6UX73 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf89Q6UX73 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf89Q6UX73 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf89Q6UX73 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf89Q6UX73 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf89Q6UX73 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf89Q6UX73 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf89Q6UX73 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf89Q6UX73 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf89Q6UX73 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C16orf89Q6UX73 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C16orf89Q6UX73 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C16orf89Q6UX73 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C16orf89Q6UX73 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C16orf89Q6UX73 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C16orf89Q6UX73 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C16orf89Q6UX73 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms