Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX46

ALKAL2, ALK and LTK ligand 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL2Q6UX46 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALKAL2Q6UX46 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALKAL2Q6UX46 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms