Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SAMD1Q6SPF0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SAMD1Q6SPF0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAMD1Q6SPF0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms