Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOA5Q6Q788 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOA5Q6Q788 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.4 ms