Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms