Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL35Q6PF15 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms