Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF06

TRMT10B, tRNA methyltransferase 10 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT10BQ6PF06 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT10BQ6PF06 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms