Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNNM4Q6P4Q7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM4Q6P4Q7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms