Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC27A4Q6P1M0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms