Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R18Q6NYC8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R18Q6NYC8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R18Q6NYC8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R18Q6NYC8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP1R18Q6NYC8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R18Q6NYC8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms