Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRPF40BQ6NWY9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF40BQ6NWY9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms