Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UFSP1Q6NVU6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UFSP1Q6NVU6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms