Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP8Q6NSW7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms