Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LCN12Q6JVE5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms