Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MCTP1Q6DN14 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCTP1Q6DN14 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms