Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LGALS9CQ6DKI2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LGALS9CQ6DKI2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LGALS9CQ6DKI2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LGALS9CQ6DKI2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LGALS9CQ6DKI2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LGALS9CQ6DKI2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LGALS9CQ6DKI2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LGALS9CQ6DKI2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LGALS9CQ6DKI2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LGALS9CQ6DKI2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LGALS9CQ6DKI2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LGALS9CQ6DKI2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LGALS9CQ6DKI2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LGALS9CQ6DKI2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LGALS9CQ6DKI2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LGALS9CQ6DKI2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LGALS9CQ6DKI2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms