Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TXNDC8Q6A555 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TXNDC8Q6A555 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNDC8Q6A555 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms