Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
INTS3Q68E01 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms