Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLX4IPQ5VYV7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLX4IPQ5VYV7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLX4IPQ5VYV7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms