Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms