Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRAMEF18Q5VWM3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRAMEF18Q5VWM3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF18Q5VWM3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF18Q5VWM3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF18Q5VWM3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF18Q5VWM3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF18Q5VWM3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRAMEF18Q5VWM3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF18Q5VWM3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF18Q5VWM3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF18Q5VWM3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRAMEF18Q5VWM3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms