Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RNF20Q5VTR2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF20Q5VTR2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms