Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC7AQ5VTJ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC7AQ5VTJ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms