Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF220Q5VTB9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF220Q5VTB9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF220Q5VTB9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms