Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC38Q5VT99 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms