Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIF1Q5UIP0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIF1Q5UIP0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms