Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN9Q5TKA1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms