Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2LQ5T4T6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2LQ5T4T6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms