Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZFYVE27Q5T4F4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZFYVE27Q5T4F4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZFYVE27Q5T4F4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZFYVE27Q5T4F4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZFYVE27Q5T4F4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZFYVE27Q5T4F4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZFYVE27Q5T4F4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZFYVE27Q5T4F4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZFYVE27Q5T4F4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZFYVE27Q5T4F4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZFYVE27Q5T4F4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZFYVE27Q5T4F4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms