Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NHSL1Q5SYE7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NHSL1Q5SYE7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NHSL1Q5SYE7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms