Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC158Q5M9N0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC158Q5M9N0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms