Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SPECC1Q5M775 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms