Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB41Q5JT25 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB41Q5JT25 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB41Q5JT25 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms