Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR44Q5JSH3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR44Q5JSH3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR44Q5JSH3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms