Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TDRD12Q587J7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms